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http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/3244
metadata.dc.type: | Tese |
Title: | Estudos estruturais das enzimas urocanato hidratase de Trypanosoma cruzi, gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase de Schistosoma mansoni e glicose -6-fosfato-1-empimerase de Naegleria gruberi |
metadata.dc.creator: | Boreiko, Sheila |
metadata.dc.contributor.advisor1: | Iulek, Jorge |
metadata.dc.contributor.advisor-co1: | Silva, Marcio |
metadata.dc.contributor.referee1: | Ambros, André Luis Bertelli |
metadata.dc.contributor.referee2: | Canteri, Maria Helene Giovanetti |
metadata.dc.contributor.referee3: | Galvão, Carolina Weigert |
metadata.dc.contributor.referee4: | Pereira, Romaiana Picada |
metadata.dc.description.resumo: | O estudo estrutural de enzimas participantes de rotas metabólicas de organismos patogênicos ou seus congêneres pode servir de base para o planejamento de inibidores. Neste contexto, o presente trabalho traz as estruturas tridimensionais de três enzimas: Urocanato Hidratase de Trypanosoma cruzi, Gliceraldeído-3-Fosfato Desidrogenase de Schistosoma mansoni e Glicose-6-Fosfato-1-Epimerase de Naegleria gruberi. A Urocanato Hidratase participa da via metabólica da L-histidina: foi cristalizada, teve sua estrutura resolvida a 2,16 Å de resolução e foi depositada no PBD sob código 6UEK. Comparações estruturais indicaram diferenças entre as conformações dos monômeros A e C, exploradas para entender mudanças estruturais na catálise; também utilizou-se a estrutura para fazer considerações sobre mutações naturais encontradas nas enzimas humanas correspondentes. A Gliceraldeído-3-Fosfato Desidrogenase participa da via glicolítica e teve sua estrutura resolvida a 2,51 Å de resolução, que foi depositada no PDB sob código 7JH0. Esta é a única GAPDH que apresenta a sequência NNR (resíduos 114-116), que leva (especialmente a R116) a uma rede de ligações de hidrogênio que possivelmente repercute na flexibilidade dos resíduos para interagir com o anel adenina do NAD+, resíduos esses especulados como importantes para o desenho diferencial de inibidores. A Glicose-6-Fosfato-1-Epimerase, também faz parte da via glicolítica, teve sua estrutura modelada por homologia ante a impossibilidade de se obter cristais de boa qualidade. |
Abstract: | Structural studies of enzymes that participate in the metabolic pathways of pathogenic organisms or their congeners can serve as a basis for planning inhibitors. In this context, this work unveils the three-dimensional structures of three enzymes: Urocanate Hydratase from Trypanosoma cruzi, Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase from Schistosoma mansoni and Glucose-6-Phosphate-1-Epimerase from Naegleria gruberi. Urocanate Hydratase participates in the L-histidine metabolic pathway; it was crystallized and had its structure solved at 2.16 Å resolution, which was deposited in the PBD under code 6UEK. Structural comparisons indicated differences in the conformation of monomers A and C, which were explored to understand structural changes in the catalysis; we also use the structure to make considerations about natural mutations found in the corresponding human enzymes. Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase participates in the glycolytic pathway and had its structure solved at 2.51 Å of resolution, which was deposited in the PDB under code 7JH0. This is the only GAPDH that has the NNR sequence (114-116), which leads to (especially R116) a network of hydrogen bonds that possibly reflects on the flexibility of the residues to interact with the NAD+ adenine ring, residues that are speculated to be important for the differential design of inhibitors. Glucose-6-Phosphate-1-Epimerase, also part of the glycolytic pathway, had its structure modeled by homology due to the impossibility of obtaining crystals of good quality. |
Keywords: | Urocanato Hidratase Trypanosoma cruzi Gliceraldeído-3-Fosfato Desidrogenase Schistosoma mansoni Urocanate Hydratase Trypanosoma cruzi Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase Schistosoma mansoni |
metadata.dc.subject.cnpq: | CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::QUIMICA |
metadata.dc.language: | por |
metadata.dc.publisher.country: | Brasil |
Publisher: | Universidade Estadual de Ponta Grossa |
metadata.dc.publisher.initials: | UEPG |
metadata.dc.publisher.department: | Departamento de Química |
metadata.dc.publisher.program: | Programa Associado de Pós-Graduação em Química - Doutorado |
Citation: | BOREIKO, Sheila. Estudos estruturais das enzimas urocanato hidratase de Trypanosoma cruzi, gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase de Schistosoma mansoni e glicose -6-fosfato-1-empimerase de Naegleria gruberi. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Estadual de Ponta Grossa, Ponta Grossa, 2020. |
metadata.dc.rights: | Acesso Aberto Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil |
metadata.dc.rights.uri: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ |
URI: | http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/3244 |
Issue Date: | 19-Oct-2020 |
Appears in Collections: | Programa Associado de Pós-Graduação em Química - Doutorado |
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